回想シーンでほとんどの謎が解けました。
鷹代陽がエボル部隊の隊長だったころ、日本は帝王タイプの群れに急襲されました。一体でも大変なのに群れの帝王タイプなら壊滅してしまいます。しかし数名のエボルの精鋭で陽は帝王の急所を突く作戦を開始しました。ほとんどスーサイドアタックなのですが、武重が封印したはずの帝王が再び動き始めて日本を守りました。武重は残った体力で完全に融合した帝王を操ったというわけです。その光景を見ていたのが子供時代のナルミ(ホワイトマッシュルーム)でした。なるほどナルミも幼少期からエボルの才能抜群でいずれば部隊に入隊するエリートだったわけです。
ナルミは武重をメシアと考えてなんとか復活させようとしています。完全に融合した武重の体から脳を取り出してクローンを作り、記憶をコピーすればオリジナルの武重と同じ人間が誕生するという塩梅です。
私はナルミのそれをやってみれば良いとさえ思いました。地上のカイジュウを一掃するには帝王タイプさえ封印できる武重クローンをたくさん用意する必要があります。しかし陽はナルミの考えに同調できず拒否しました。ナルミの考えとは人類とカイジュウが争い生き残った者が地上の支配者になるのが必然という考えです。その過程で発生したエボルこそが至高というナルミのおごった考えを陽は許せなかったのです。